通过改良环境，包括防鼠建筑、断绝鼠粮、农田改造、搞好室内外环境卫生，清除鼠类隐蔽处所。也就是控制、改造、破坏有利于鼠类生存的生活环境和条件，使鼠类不能在那些地方顺利生存和繁衍。
生态学灭鼠是综合鼠害防治中很重要的一环破坏鼠的栖息条件，断绝鼠粮的方法间接灭鼠，是治本的方法。
