由于，地铁客流量大，穿行于闹市区的地下，地铁车站会有出售食品的商店，地铁上也有乘客携带的少量食品，有时也会在地铁上发现老鼠的身影，但是经常受到侵袭的场所不是车体内，而是站台内的设施和工作人员所在的地点。
对于地铁系统鼠害的防治，应当首先进行仔细的调查，确定老鼠主要的侵害地点和经常活动的范围，做到有的放矢，有针对性的进行老鼠的防治工作，否则，针对整个地铁系统进行鼠害防治，不仅耗时耗力，而且收效甚微。在做好灭除老鼠的同时应当做好防鼠设施的建设，在堵塞鼠洞的基础上，及时清理和密封鼠类能够窃取的食物，垃圾要做到日产日清，密封保存，必要时有针对性的布放鼠夹和粘鼠板，鼠密度较高的场所还要投放毒饵以迅速降低鼠密度。
