苍蝇能机械性携带、传递的病原体很多，主要是肠道传染病，如痢疾、伤寒、脊髓灰质炎等，还有沙眼、结核病等的病原体。吸血蝇的骚扰可使家畜产肉量和产奶量大幅度下降。有些蝇类的蛆寄生于人、畜活体组织或肠道中，对寄主危害非常大。
常用的药物灭蝇方法有：
●药物灭蛆:在蝇蛆较多的公共场所、粪池、垃圾堆等孳生地，使用马拉硫磷0.2％乳剂、杀螟松0.2％乳剂，按每平方米500毫升喷洒，或使用利箭粉剂直接撒施，可有效杀灭蝇蛆。
●药物灭成蝇:空间喷雾是一种快速灭成蝇的方法。通常采用手动喷雾器、超低容量喷雾器或市售气雾罐。药品可选用利箭5号50倍空间喷雾。
●滞留喷洒:这是一种持效的灭蝇方法。主要用于厕所、禽畜圈等多蝇场所，将药剂喷洒于门窗、墙面、天花板等蝇类经常停留处。常用药剂有利箭（20克/袋，1袋兑水1斤或3袋兑水2斤摇晃均匀喷雾）、利箭2号（50克/袋，1袋兑水20—30斤摇晃均匀喷雾）、利箭5号（液剂，1升兑水7—10升，可喷雾1000平米）等。滞留喷洒，实验室效果可达到1—2个月，实际应用效果一般可以维持25天苍蝇明显减少甚至没有。
●毒绳灭蝇:利用家蝇喜欢停留在绳索等悬挂物上的习性，将直径2至4厘米的棉(麻)绳或布条等用药剂浸泡后晾干，裁成1至2米左右长度，悬挂室内天花板、畜禽棚下、周围墙壁上，距地面2至2.5米。一般每10米放2至3条即可。可供浸泡的杀虫剂有10％的甲基吡啶磷（商品名加强蝇必净），利箭2号（1袋兑水3—5斤摇晃均匀作浸泡液
